转自:美迪西Medicilon
前言导读
利用多肽药物研发服务平台,加速开发、增强特异性并简化筛选流程。美迪西助力研究人员攻克难成药靶点,优化药物稳定性和递送系统,并加速创新疗法临床转化。
更智能 + 更高效
依托生物技术和AI工具,肽类药物研发日新月异。美迪西提供一站式多肽药物研发服务平台,从高多样性化合物库构建到先导化合物优化和功能验证,助力加速药物研发进程。
选择美迪西的理由
❖75+肽类药物专家
精通合成、筛选和分析
❖mRNA展示技术
覆盖DNA到候选化合物的完整研发流程
❖经验丰富
大环肽、偶联物、放射性配体
❖创新环化技术
S-S桥、硫醚、Click反应、DBX等
❖AI肽类药物设计 + 筛选
赋能卓越研发
我们的优势
❖mRNA展示高多样性文库构建
❖固相肽合成与先进环化化学
❖基于AI的肽建模和结构虚拟筛选
依托美迪西,加速您的肽发现,实现更智能、高效的研发流程。
核心服务
mRNA展示技术
mRNA展示技术又称mRNA-蛋白质融合体展示技术,是将基因型(mRNA)与表型(多肽/蛋白)融合的体外多肽/蛋白筛选技术,将肽与其编码mRNA进行共价连接,使用嘌呤霉素作为连接物。可用于生物分子配体的发现和相互作用分析。
美迪西应用此技术构建规模超过1013的mRNA展示库,期间可以通过无细胞PURE体外翻译系统将非天然氨基酸整合到多肽中,经过靶标蛋白的亲和力筛选和洗脱,对与多肽连接的cDNA进行测序,可精准筛选到与靶标蛋白相互作用的多肽。
❖DNA库制备:使用分子生物学技术制备DNA库(通常为编码约4~14个氨基酸的环肽);
❖DNA库的体外转录:通过RNA聚合酶的作用,DNA库被转录成mRNA;
❖嘌呤霉素连接:嘌呤霉素分子通过DNA连接子序列连接到每个mRNA上,嘌呤霉素是一种抗生素,作为氨基酰化的tRNA类似物(tRNA在翻译过程中向核糖体传递氨基酸),并作为mRNA和肽之间的连接子;
❖mRNA库的体外翻译:mRNA-嘌呤霉素偶联物进行体外翻译,由核糖体翻译生成相应的肽;
❖线性肽的环化修饰:通过化学合成技术进行环化修饰;
❖逆转录:mRNA逆转录形成mRNA-cDNA双链,产生mRNA/cDNA-嘌呤霉素-肽偶联物库;
❖孵育与洗涤:将mRNA-cDNA-肽融合库与固定在固体载体上的靶蛋白一起孵育,然后进行洗涤以去除未结合的肽;
❖扩增、富集与测序:结合肽的cDNA通过PCR扩增,然后用作DNA库模板,在进一步的重复几轮mRNA展示库筛选中,富集与靶蛋白高亲和力的结合肽,最后通过cDNA的测序来确定多肽的结构。
整个过程均在体外进行,无需依靠细胞!
mRNA展示技术的优势
mRNA展示技术属于体外展示技术,与包括噬菌体展示技术在内的体内展示技术相比,具有多种优势,主要体现在更大的化合物库容量、化合物多样性、筛选过程和实验周期等。
❖更大的化合物库容量:与噬菌体展示技术相比,mRNA展示技术使用体外转录和翻译(IVTT),避免了对大肠杆菌转染的需要(而这限制了噬菌体展示库的大小在~108个序列),mRNA展示技术可以制备更大的化合物库(1012~13个序列)
❖化合物多样性:可构建引入多种非天然氨基酸的肽库
❖筛选过程中的反应条件:整个过程在无细胞条件下进行;可完全控制筛选的条件
❖实验周期:筛选测序周期更短,mRNA展示技术筛选+多肽测序周期2~3周,而噬菌体展示需要6~8周。
总之,mRNA展示技术由于其突出的优势拥有广泛的应用场景。
mRNA展示肽库的环化修饰
❖硫醚环化:基于半胱氨酸与功能基团(如mCNP)的自发或试剂驱动的大环化,适用于单/双环结构。
❖DBX环化:间/对-二溴二甲苯 (DBX) 介导的半胱氨酸硫醚键合,形成刚性双环肽,提升血浆稳定性和靶标亲和力。
环化可增强肽稳定性与功能!
基于计算的虚拟筛选 (in silico screening)
整合多种计算方法,加速目标化合物识别与优化:
❖基于结构的对接
利用Rosetta、AutoDock、CrankPep (ADCP)、HADDOCK等工具模拟肽-靶标结合。
❖AlphaFold集成
AF-Multimer根据序列预测肽-蛋白复合物,并结合MD模拟进行优化。
多肽药物合成与验证平台
❖固相和液相合成
1)线性肽
2)环肽:S-S桥、内酰胺、硫醚、Click反应等
3)修饰肽:聚乙二醇化、同位素标记、荧光修饰、肽蛋白偶联等
❖放大
❖从mg到100 g
❖自动化HPLC纯化
❖冻干
参考文献
[1]. Hayden Peacock, et al. Discovery of De Novo Macrocyclic Peptides by Messenger RNA Display. Trends Pharmacol Sci.2021 May;42 (5):385-397. doi: 10.1016/j.tips.2021.02.004.
美迪西(股票代码:688202.SH)成立于2004年,总部位于上海,致力于为全球制药企业、研究机构及科研工作者提供全方位的临床前新药研究服务。美迪西的一站式综合服务以强有力的项目管理和更高效、高性价比的研发服务助力客户加速新药研发进程,服务涵盖医药临床前新药研究的全过程,包括药物发现、药学研究及临床前研究。至2024年底,美迪西已为全球超2000家客户提供药物研发服务,参与研发完成的新药及仿制药项目已有520件IND获批临床,与国内外优质客户共同成长。美迪西将继续立足全球视野,聚力中国创新,为人类健康贡献力量!
(转自:美迪西Medicilon)