转自:生物谷(维权)
类器官药物筛选及全景3D 成像技术培训班
器官药物筛选及全景3D 成像技术在生命科学、医学研究及药物研发等领域具有至关重要的作用。器官药物筛选技术有助于快速、精准地发现针对特定疾病的有效药物,降低研发成本和周期;全景 3D 成像技术则能够提供生物组织和器官的高分辨率三维结构信息,为疾病诊断、治疗方案制定以及药物疗效评估等提供关键依据。
2013年,类器官被《Science》杂志评为年度十大技术,后又被评为2017年《Nature Methods》的年度方法。目前,从高质量文章的发表和自然基金立项情况来看,类器官仍然是科研界热衷的研究领域。
类器官药物筛选及全景3D 成像技术在生命科学、医学研究及药物研发等领域具有至关重要的作用。器官药物筛选技术有助于快速、精准地发现针对特定疾病的有效药物,降低研发成本和周期;全景 3D 成像技术则能够提供生物组织和器官的高分辨率三维结构信息,为疾病诊断、治疗方案制定以及药物疗效评估等提供关键依据。
为了促进相关技术的广泛应用和交流,提高科研人员和技术人员在该领域的专业水平。浙江大学联合多位科研一线领军教师倾情推出类器官药物筛选及全景3D成像技术应用研习班,通过理论授课与实验操作相结合的方式,由专业技术老师现场指导,帮助学员系统学习类器官技术从原理、应用实操的各个环节,为后续应用类器官技术开展各类研究打下坚实基础。
类器官
技术
培训内容
培训时间
2025年6月19日-22日
培训地点
杭州 浙江大学紫金港校区
历届师资
蒋明 研究员
浙江大学“百人计划”研究员 博士生导师。
浙江大学遗传学研究所/浙江大学附属儿童医院双聘研究员。
研究方向聚焦于前肠起源的器官包括食管和肺的干细胞在器官发育及相关疾病中的功能。主要研究不同的干细胞参与损伤后修复以及在肿瘤形成过程中的作用,并且深入了解其分子机制,为疾病的临床诊断和治疗奠定坚实的理论基础与科学依据。同时深入探究参与胚胎发育,器官生成,干细胞动态平衡及机关疾病的信号通路,尤其对WNT信号通路在其中的功能研究。以第一或者共同通讯作者在Nature,Journal of Clinical Investigation,PNAS和Development等杂志发表了多篇论文。
贺 永 教授
国家杰出青年科学基金获得者,
浙江大学机械工程学院教授,博士生导师
流体动力与机电系统全国重点实验室副主任,Bio-Design Manufacturing 期刊副主编、Biofabrication期刊编委。从事增材制造(3D打印)、生物制造等方面的研究工作,主持杰青、基金重点、优青、联合基金重点等国家自然科学基金6项,出版生物3D打印专著2本,授权发明专利50余件,在Science Translational Medicine、Nature Communications、Science Advances等期刊发表SCI论文100余篇,H因子56,论文被引9600余次。担任国家医用增材制造标准委员会设备组牵头人、生物材料学会先进制造分会副主任委员、机械工程学会生物制造分会常务委员,创建EFL品牌(Engineering for Life),致力于医工交叉研究及成果转化。
蔡志伟 研究员
博士,上海交通大学医学院附属仁济医院临床干细胞中心PI、研究员和博导,并担任癌基因与相关基因国家重点实验室研究组组长及仁济泌尿外科兼职教授;现为上海市高层次人才项目入选者、东方学者及医学院“双百人”。于2002获得Universiti Kebangsaan Malaysia生物医学学士;2009年取得香港大学癌症生物学博士;2009至2017年,在美国哥伦比亚大学医学中心先后进行博士后训练及担任副研究员。在博士后期间,利用前列腺癌基因工程小鼠模型,重点探究雄激素受体(AR)在前列腺上皮管腔细胞的作用机制;此课题获得美国国防部前列腺癌研究计划博士后研究基金的资助,及美国癌症研究协会Scholar-in-Training奖。此外,成功建立一种全新的类器官培养系统,用于长期体外培养前列腺管腔祖细胞、前列腺和膀胱癌。这些研究成果已发表在国际顶尖杂志,如Nature Cell Biology, eLife和Cell,并获得国际专利2项。作为类器官培养系统的发明者,获邀在Cold Spring Harbor Laboratory举办的首届“The Organotypic and Next Generation Culture”工作坊担任实验导师,教授来自世界各国的青年学者有关类器官的培养方法。同时,作为eLife Community Ambassador,致力推动发展中国家青年科学家的职业培训项目。课题组先后获得国家自然科学基金面上项目2项、青年项目1项,以及上海市科委“一带一路”国际合作项目1项。
郑智国 副研究员
博士、硕士生导师浙江省肿瘤医院生物样本库主任
中国抗癌协会肿瘤样本整合研究分会常委
中国医药生物技术协会组织生物样本库分会常委
中国研究型医院学会临床数据与样本资源库专业委员会委员
全国生物样本标准化技术委员会(SAC/TC559)委员
浙江省数理医学学会新型生物标志物专业委员会副主任委员
作为第一负责人主持国家自然科学基金青年科学基金和省自然科学基金项目4项,在国内外杂志署名发表SCI论文30多篇;主笔和参与生物样本库国家标准制订7项,参与团体标准制订1项等,第一或参与获得10项国家发明专利。
葛学美 研究员
生物芯片上海国家工程研究中心首席科学家,近几年在巴塞罗那大学肿瘤医院肿瘤代谢实验室以博士后的身份从事肿瘤的药物治疗研究,研发了肝癌、胆管癌、直结肠癌等肿瘤病人活体肿瘤组织或冻存的组织的3-D培养模式-肿瘤类器官。2018年,在国内收集了141例临床肝癌手术标本,建立了39例肿瘤类器官,在18例的类器官药物试验中,新型的mTOR抑制剂效果显著。该治疗作用在10多例肝癌PDX及其肿瘤类器官形成的荷瘤小鼠ODX的药物试验中得到了进一步的验证。该技术将为肝癌等肿瘤患者建立个体化的及肿瘤发展不同阶段的organoid模型,有针对性地筛选有效药物,及时筛选有效药物及药物组合,由此尽可能避免耐药性的出现;而在耐药性出现时,又可及时发现耐药机制,筛选和更换更有效的药物。
李程 博士
中国科学院上海生命科学学院生化与分子生物学专业博士,本科毕业于浙江大学生物技术系。从事干细胞及肿瘤类器官模型构建、精准医疗技术转化方向的研发与管理工作十五年,曾任浙江中赢方舟生物工程股份有限公司研发总监,杭州易文赛生物技术有限公司研发总监,浙江生创精准医疗科技有限公司常务副总,杭州观梓健康科技有限公司总经理,浙江科途医学科技有限公司总经理。曾参与包括国家“863计划”一项、国家自然科学基金二项,国家重点研发计划一项和国家重大新药创制科研专项一项,发表SCI论文4篇。作为专利发明人获得授权国家发明专利21项,授权实用新型专利7项。在干细胞及肿瘤类器官模型构建领域具有丰富实践经验。
何康信 博士
依托于浙江大学医学院附属第一医院以及其他合作医院,开展的转化医学研究很好地利用了类器官的优越特性,为学术研究和临床应用的开发提供支持。同时涵盖了类器官生物样本(活)库的建设、个性化肿瘤类器官药敏检测、器官芯片、类器官与微生物相互作用等领域,尤其是在正常组织来源的类器官的造模方面有较多的实践经验。
韩晓 博士
南京医科大学药学院干细胞与神经再生研究所讲师。神经生物学方向,主要探究FoxG1在端脑发育早期对皮层神经元命运决定的调控作用。同年,加入南京医科大学干细胞与神经再生研究所刘妍教授课题组,主要从事体细胞重编程、人脑类器官体系构建以及应用iPSC阐明脑发育疾病,如自闭症、亨廷顿病和唐氏综合征等致病机制方面的研究。以第一作者或共同作者在JCI、Life medicine、 Cerebral cortex、Neuropharmacology、Frontiers in molecular neuroscience、Frontiers in cellular neuroscience等杂志发表相关研究成果。目前,韩晓博士正作为项目负责人参与国家自然科学基金重点项目。
李星南 博士
来自美国斯坦福大学Kuo团队的核心成员,从事类器官及肿瘤研究超过15年时间。迄今在Cell、Nature、Nature Medicine、PNAS等顶尖生物医学杂志上发表多篇类器官及干细胞领域相关的论文,他引数超过5000次。其核心论文于2018年发表于《Cell》,论述了通过ALI法培养患者来源类器官(patient derived organoids, PDOs)首次实现人源样本原生微环境的体外模拟,并在该模型上重现了免疫筛查位点依赖性的T细胞应答;开创了以新型PDO为基础的免疫靶向治疗体外评估体系。Nature Review Cancer评述ALI PDOs为Organoid 2.0,至今该论文的他引数已超过800次。
注册方式
注册方式:
①培训费:5800元/人(包含注册费、资料费、肿瘤细胞等实验材料费)。
培训期间食宿自理,会务组可帮助预定。
②汇款方式(非汇款学员可现场刷卡或支付宝扫码)
账户名称:浙江大学
账户号(开户行):19042201040000014(农行杭州市浙大支行紫金港分理处)
汇款用途处写明:姓名+学号(由会务组在回执确认函中提供)
③会务组联系方式:姜老师
17321098232(微信同号)
“基因组科学”研习班
开班时间:2025年7月13-19日(13日全天报道,14日起授课)
上课内容:基因组学、系统生物学、蛋白质组学、单细胞组学
上机实习: R语言数据分析与绘图;蛋白质结构与功能分析;蛋白质组学数据分析;系统生物学软件实习;单细胞转录组数据分析实例;转录组与空间转录组整合分析等
研习班创始于2003年10月,由DNA双螺旋结构的发现者詹姆斯·杜威·沃森教授与浙江大学沃森研究院首任院长杨焕明教授共同创办,2007年后由浙江大学浙江加州国际纳米技术研究院继续承办,研习班旨在通过基因组、蛋白质组、系统生物学等内容的系统讲授,为学员打开生物信息学的全新领域。
教授团队联袂授课:
著名基因组学专家于军研究员、中科院微生物所胡松年研究员、浙江大学陈铭教授、徐建红教授、钟伯雄教授、杨军教授、谷红仓研究员等多位基因组领域大咖专家为你在高通量分析研究方法和思路方面答疑解惑。
百人平台携手科研:
至今我们已举办63期,每期近百人,学员遍布全国30余个省市。每次研习班都有近30%教授、研究员等高级职称技术人员参加。他们中有一些带着课题或问题前来交流和联系;也有的通过研习班建立了协作关系,共同申请课题,发表论文,其中不少优秀研究成果,已在SCI期刊上发表。
一、培训班上课内容、
上课内容涵盖“基因组学—蛋白质组学—系统生物学—单细胞组学”的研究方法、技术思路、前沿进展及其在各生物学科中的应用。
基因组
科学
二、培训班上机内容
本研习班上机实习课采用 “跟我学”方式,学习实践各类基础生物信息学软件,每人一台PC机跟着大屏幕一步步学会基因组、蛋白质组学数据分析的基本方法。
主要内容如下:
上机实习:R语言数据分析与绘图
介绍转录组数据分析的基本流程及其原理;通过对tophat、cufflinks、R等转录组数据分析工具的介绍及演示,了解基于二代测序数据的转录组分析流程及常用分析方法;利用kegg、GOstat、DAVID等在线工具挖掘转录组数据的生物学意义。
上机实习:医疗大数据机器模型的构建
数据获取;数据清洗;特征过程;模型选择;模型训练;模型评估;模型部署
上机实习:蛋白质结构与功能分析
从数据库搜索感兴趣的蛋白质氨基酸序列开始,接着对蛋白质基本理化性质、二级结构、和三维空间结构和序列模体进行分析,预测目标蛋白的生物功能。
上机实习:蛋白质组学数据分析
使用X!Tandem、Mascot、Sequest等软件鉴定蛋白质质谱数据,将质谱结果匹配到蛋白质组数据库鉴定蛋白;使用TPP软件包进行统计学分析和优化检索结果练习。
上机实习:系统生物学软件实习
利用Cytoscape系统生物学分析软件,分析蛋白-蛋白相互作用,展示分子网络系统,并与基因表达等数据整合。
上机实习:单细胞转录组数据分析实例
研究单个细胞内的基因表达情况,解析单个细胞的行为、机制及其与机体的关系成为了现实。
上机实习:转录组与空间转录组整合分析
从空间层面上解析RNA-seq数据的技术,从而解析单个组织切片中的所有mRNA,从而能够定位和区分功能基因在特定组织区域内的活跃表达。
三、培训对象
1. 无生物信息学背景,希望了解生物信息学的学员;
2. 计划开展各类组学研究的科研人员;
3. 已有组学数据需了解分析方法的研究人员;
4. 有志从事生物信息学相关工作的学生或者技术人员。
四、主要师资
于 军 研究员
中国基因组学研究奠基人之一
华大基因研究中心(中国科学院北京基因组研究所)的主要创始人之一
曾担任国家科技部重大科学计划转录组研究首席科学家。多年来致力于基因组学、生物信息学研究、推动测序技术发展。1997年任职于美国华盛顿大学人类基因组研究中心,是早期参与人类基因组计划的唯一华人科学家;1998年回国推动了中国科学家参与人类基因组计划。除了主持 “人类基因组计划北京部分”,又先后主持了“中国杂交水稻基因组计划”、“家蚕基因组计划”、“鸡基因组多态性研究计划”、“中-沙椰枣基因组计划”等多项大型基因组研究计划。先后获得2002年中国科学院“百人计划”(海外杰出人才)、2002年度香港求是科技基金会“求是杰出科技成就奖”、2002年《科学美国人》杂志评首届“年度全球科研领袖”、2003年度“中国科学院杰出科技成就奖”,2012年度“发展中国家科学院农业奖”。目前担任Genes分子遗传学和基因组学专栏 (Section: 'Molecular Genetics and Genomics') 的客座编辑。
胡松年 研究员
中国科学院微生物研究所研究员
曾担任中国科学院遗传与发育研究所人类基因组中心总工程师,并作为主要负责人参与和完成了国际人类基因组计划(Human Genome Project)中国卷测序项目。开发基于单细菌水平的宏基因组检测技术与新型建库技术,为宏基因组研究提供精准采样与检测的实验基础;开发对于整体代谢调控网络、微生物群落进化与疾病表型关系的分析工具,为精准医学的应用提供分析手段。围绕微生物组学研究与动、植物、人体多组学数据,构建全息组学研究平台,对不同样本提供前期收集、实验流程的质控方法,进而能够对长期样本进行横/纵向比较。对微生物重要基因及功能元件进行鉴定与挖掘,分析微生物基因组元件的进化与传递机制特征,预测新功能元件,为合成生物学、微生物组、基因组编辑等提供基础数据。
杨 军 教授
教育部新世纪优秀人才支持计划入选者
浙江省“151”人才第二层次入选者、
主要研究通过分子生物学、系统生物学技术研究化学损伤,尤其是DNA损伤应激的分子机制。已发表研究论文150余篇,其中SCI论文100余篇。主持国家重点基础研究计划(973)子课题1项、国家高技术研究发展规划项目(863)1项、科技部国际科技合作专项1项、国家自然科学基金7项及其他省部级项目多项。担任国际环境诱变剂学会(IAEMSG)、亚洲环境诱变剂学会(AAEMS)理事,中国环境诱变剂学会副秘书长、常务理事,致突变专委会主任委员,外事工作委员会主任委员,浙江省毒理学会副理事长。
钟伯雄 教授
浙江大学动物科学学院教授
开展了家蚕丝腺蛋白质组、以及与野蚕后部丝腺的比较蛋白质组学研究,发现蚕茧优质高产主要是核糖体蛋白代谢通路提高;(2)开展了蛋白翻译后修饰研究,明确了与蚕茧优质高产相关的蛋白质磷酸化特征;(3)建立了高效转基因方法,采用TALEN技术在家蚕胚胎时期成功获得基因定点插入研究结果、采用CRISPR-Cas9技术成功突变家蚕重要功能基因,获得稳定遗传突变品种(4)开展了micRNA研究工作,揭示了家蚕丝腺micRNA表达特征。(5)开展了家蚕生物反应器研究,获得了机械性能优良的家蚕蜘蛛复合丝新材料。在JPR、BMC Genomics、IBMB、遗传学报、蚕业科学等国内外杂志发表相关论文160多篇。
陈 铭 教授
浙江大学生物信息学学科带头人
担任浙江省生物信息学学会理事长
长期从事生物信息学与系统生物学方面的科教工作,致力于组学大数据整合与挖掘,非编码RNA生物信息学研究、生物网络建模分析以及精准医学方面的科学研究。共发表学术论文200余篇,Google Scholar H指数43。现曾担任中国系统仿真学会生命系统建模仿真专业委员会副主任委员、中国运筹学会计算系统生物学分会理事会常务理事、中国细胞生物学学会功能基因组信息学与系统生物学分会理事、中国医药生物技术协会生物医学信息技术分会委员会委员;教育部“新世纪优秀人才”,浙江省“151人才工程”第一层次。
徐建红 教授
浙江大学作物科学研究所副所长,博士生导师
浙江省作物种质资源重点实验室副主任
主要从事植物分子生物学与基因组学研究,主要的研究方向是基于大数据与基因编辑技术在基因表达的表观调控(DNA甲基化和miRNA),种子品质性状形成的分子机理,作物转座子分子标记的开发与转座机理研究以及水稻温敏不育系的选育与育性转育机理和基因与基因组的分子进化等。主要研究内容已在PNAS、Genome Research、Molecular Biology and Evolution、PLoS Genetics、Molecular Plant、Plant Journal、Plant Biotechnology Journal等高质量期刊上发表。
谷红仓 研究员
中科院合肥研究院健康与医学技术研究所二级研究员,博士生导师
2004年博士毕业于美国肯塔基大学;2004年8月至2006年7月在哈佛大学医学院病理系从事博士后工作;2006年7月加入哈佛大学&麻省理工学院博德研究院(The Broad Institute of Harvard and MIT)任研究员I;2013年7月晋升为研究员ll并任职至2018年6月。谷红仓博士在2018年7月到2020年6月期间参加由美国医学遗传专家委员会(American Board of Medical Genetics and Genomics, ABMGG)与美国俄克拉荷马大学医学院联合举办医学遗传学专科资质培训 , 现为ABMGG执业专家。自2018年7月至今,兼职于哈佛大学&麻省理工学院博德研究院任客座研究员。2020年10月加入中科院合肥研究院。
五、证书发放
六、收费标准:
4800/人(含教材,转账、刷卡、支付宝)
户 名:浙江大学
帐 号:19042201040000014
开户银行:农行杭州市浙大支行紫金港分理处 (汇单上务必写上:培训上机号)
培训发票由浙江大学计财处开具电子票据。
住宿可统一安排,费用自理。
联 系 人:姜老师
因本课程天数较多,报名学员因故缺席部分课程,可联系会务组在后续培训班中免费旁听。
(转自:生物谷)