衰老是生物体多系统功能减退的复杂过程,其分子机制研究一直是生物学领域的核心挑战。
环状RNA(circRNA)作为近年来生命科学研究的热点,被证实与神经退行性疾病、心血管疾病、癌症等多种衰老相关疾病的发生发展密切关联。
针对衰老相关circRNA研究资源缺乏的现状,中国科学院昆明动物研究所构建了CircAge数据库(www.circage.org),聚焦解析circRNA在衰老进程中的动态表达特征、潜在生物学功能及其调控机制,为衰老机制的深入研究和转化应用奠定坚实的资源基础。
▲CircAge数据库主要内容与功能01
跨物种多维解析
CircAge数据库专注于circRNA在衰老过程中的表达变化,采用“大数据+多物种”策略,整合了人类、猕猴、小鼠、大鼠、果蝇、线虫及斑马鱼等7个物种、24种组织、涵盖多个关键时间点的803个公共样本数据。
通过严格的质控与标准化处理,数据库系统整合了超过52万个circRNA,构建了目前最全面的衰老相关circRNA跨物种表达图谱。
数据库提供多维度的功能注释信息,支持科研人员从多个角度深入解析circRNA的潜在生物学作用,包括:
时序表达趋势分析:追踪衰老进程中的动态变化
调控网络预测:识别miRNA及RNA结合蛋白(RBP)作用靶点
跨物种保守性分析:分析核心circRNA的演化规律
编码潜能评估:挖掘功能性多肽的翻译潜力
基于上述多维注释信息,数据库构建了circRNA-调控因子(miRNA/RBP)交互网络,为深入理解其调控机制提供关键线索。
▲CircAge数据处理流程02
推动衰老生物学持续发展
CircAge数据库提供了可视化界面与高效搜索功能,支持用户按物种、组织、基因等多种条件检索相关circRNA信息。
同时提供调控网络图、功能预测结果及表达分布图等丰富的数据资源,方便研究者获取与分析研究结果,有助于推动circRNA在衰老生物学与相关疾病研究中的应用。
作为首个专注于衰老相关circRNA的专业数据库,CircAge数据库为衰老调控机制研究、生物标志物发现及治疗靶点筛选提供了重要支撑。
未来,研究团队将持续更新数据库内容,整合更多物种和组织数据,不断完善功能模块,推动circRNA在衰老生物学和临床研究中的转化应用。